Superman，Batman和Robin正在進行慈善體育表演，突然被Luthor駛來的噴氣機打斷。Luthor挑釁道他可以摧毀任何城市，Superman有本事就來阻止他啊，然後就飛走了。Superman用超級視線追著噴氣機來到Luthor老巢，而Batman和Robin也很快趕到。可房間里一個人也沒有，只有臺詭異的機器。英雄們覺得Luthor一定是跑得太匆忙，連自己的發明都落下了。於是Superman把它帶回孤獨堡壘，準備研究一下這到底是做什麼用的。

Superman每次回家都會自信心滿滿地想自己如導向標一般的門鑰匙設計多麼巧妙蒙過了所有飛行員、數噸重的門鑰匙只有自己能搬動等等，殊不知Luthor一行人把自己縮小后躲在機器里跟著混進來了。他們趁Superman去拿拆機器的工具的時候乘上縮小的帶鑽頭飛機，鑽進了Kandor。

Superman回來時發現自己被耍，意識到Luthor想摧毀的城市正是Kandor。在讀了嘲諷的小紙條后，他戴上Luthor留下的一條腰帶跟了進去。由於Superman在Kandor並沒有超能力，他只能乘降落傘下降，準備警告城裡的氪星人。

Superman一落地就發現自己又中了Luthor的圈套，被他的手下圍攻。雖然Superman的肌肉不是白練的，但他還是慢慢地招架不住昏了過去。Luthor把Superman的腰帶解下來，覺得這樣一來就能把他永遠困在瓶子里了。Luthor知道氪星文明的先進，臨行前準備在博物館轉轉，看看有沒有能用得上的發明。

Luthor沒考慮到的是，無論他抓了Superman還是Batman，沒被抓的人總會盡全力來救對方的。Batman和Robin覺得事情蹊蹺，回了Luthor的據點，發現果然有兩個歹徒在那兒準備把備用腰帶轉移到新據點。Batman聽到他們在談制服Superman的事，怒問這事怎麼回事。嚇呆的歹徒一五一十地把Luthor的計劃告訴了他，而Batman和Robin聽罷立即飛到了孤獨堡壘。

當年Batman還沒拿到Superman的家門鑰匙，被鎖在外面進不去，靈機一動用腰帶發出的射線把蝙蝠機也變小了，飛進鎖眼在Kandor降落。他找到并解救了Superman，和Robin匯合后一起去找Luthor算賬。Luthor以為活力雙雄也是用降落傘飛下來的，準備在他們身上試試他找到的氪星新玩具。

在射火球的大炮面前，Superman忘了自己超能力失效，毫不猶豫地衝了上去。還好Batman及時撲倒他，而Robin趁機一個蝙蝠鏢破壞了操作臺。Luthor又開著機器想把三人踩扁，Batman感嘆到Superman要還能飛就好了。於是Superman指揮著Batman用一台可以高壓噴氣的機器把自己噴上位於機器頂端的操控室，揍倒了Luthor身邊的兩個歹徒。

Luthor又蹦上帶有錘頭的飛車撞向Batman和Robin。Superman帶著二人躲進建築內，可Luthor把建築撞塌了，把三人埋在廢墟下。Luthor本計劃困住Superman，沒想到連活力雙雄也一併困住了，十分得意。他和手下把氪星機器打包帶走，又在孤獨堡壘里到處溜達，看看有沒有什麼其它可以一起帶走的東西。

Luthor不知道的是，他撞毀的建築下面是有地下室的，而Superman領著Batman和Robin沿地道跑了出來。他們乘蝙蝠機飛出Kandor，準備變回原來尺寸時卻遭遇了麻煩──只有Robin的腰帶還管用，Superman和Batman的剛才被撞壞了。

轉回來的Luthor一行人發現了逃離Kandor的三人。Robin掙扎著和歹徒們搏鬥，心想如果不用射線把Superman和Batman變回來的話，他們就得永遠保持這尺寸了。Luthor見二人還是迷你尺寸，一腳踩了下去，卻忘了Superman雖然身體小，但超能力還是那麼強，一下就被掀翻在地。

他的手下見情況不妙趕緊跑，卻誤打誤撞闖入了Superman給Batman建的紀念室，被小Superman用大硬幣打翻。Batman則把歹徒的鞋帶和自己雕像的靴子系到了一起，輕鬆把他絆倒。Superman見狀讚歎Batman真可愛，讓自己的雕像替自己打。

在制服所有歹徒后，Batman和Superman恢復了原本尺寸。由於Luthor一行人飛進來時是躲在機器里，自然不知道孤獨堡壘的具體地點，眼睛上蒙塊布送到監獄就解決問題了。在Batman和Robin的幫助下，Superman母星的人民又可以無所畏懼地生活下去了。